Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms