RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614066.4

TULP1-208, Transcript of tubby like protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TULP1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1-208ENST00000614066 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.88■■■■■ 4.45
TULP1-208ENST00000614066 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.37■■■■□ 3.57
TULP1-208ENST00000614066 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
TULP1-208ENST00000614066 ABCC9O60706 1549 aa35.84■■■■□ 3.33
TULP1-208ENST00000614066 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.76■■■■□ 3.32
TULP1-208ENST00000614066 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.34■■■■□ 3.25
TULP1-208ENST00000614066 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.02■■■■□ 3.2
TULP1-208ENST00000614066 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.98■■■■□ 3.19
TULP1-208ENST00000614066 NACADO15069 1562 aa34.94■■■■□ 3.18
TULP1-208ENST00000614066 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.72■■■■□ 3.15
TULP1-208ENST00000614066 SCRIBQ14160 1630 aa34.5■■■■□ 3.11
TULP1-208ENST00000614066 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.02■■■■□ 3.04
TULP1-208ENST00000614066 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.84■■■■□ 3.01
TULP1-208ENST00000614066 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.74■■■□□ 2.99
TULP1-208ENST00000614066 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
TULP1-208ENST00000614066 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.44■■■□□ 2.94
TULP1-208ENST00000614066 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
TULP1-208ENST00000614066 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.16■■■□□ 2.9
TULP1-208ENST00000614066 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
TULP1-208ENST00000614066 SMARCA4P51532 1647 aa32.99■■■□□ 2.87
TULP1-208ENST00000614066 WIZO95785 1651 aa32.86■■■□□ 2.85
TULP1-208ENST00000614066 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
TULP1-208ENST00000614066 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.57■■■□□ 2.8
TULP1-208ENST00000614066 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.55■■■□□ 2.8
TULP1-208ENST00000614066 SMARCA2P51531 1590 aa32.47■■■□□ 2.79
TULP1-208ENST00000614066 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
TULP1-208ENST00000614066 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
TULP1-208ENST00000614066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.35■■■□□ 2.77
TULP1-208ENST00000614066 NCAPD3P42695 1498 aa32.31■■■□□ 2.76
TULP1-208ENST00000614066 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.2■■■□□ 2.74
TULP1-208ENST00000614066 HMGXB3Q12766 1538 aa32.17■■■□□ 2.74
TULP1-208ENST00000614066 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.99■■■□□ 2.71
TULP1-208ENST00000614066 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.87■■■□□ 2.69
TULP1-208ENST00000614066 CFTRP13569 1480 aa31.53■■■□□ 2.64
TULP1-208ENST00000614066 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.51■■■□□ 2.64
TULP1-208ENST00000614066 TRIM41Q8WV44 630 aa31.48■■■□□ 2.63
TULP1-208ENST00000614066 ABCC8Q09428 1581 aa31.45■■■□□ 2.63
TULP1-208ENST00000614066 NESP48681 1621 aa31.39■■■□□ 2.61
TULP1-208ENST00000614066 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.24■■■□□ 2.59
TULP1-208ENST00000614066 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.21■■■□□ 2.59
TULP1-208ENST00000614066 PRDM2Q13029 1718 aa31.18■■■□□ 2.58
TULP1-208ENST00000614066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.15■■■□□ 2.58
TULP1-208ENST00000614066 SYNJ1O43426 1573 aa31.11■■■□□ 2.57
TULP1-208ENST00000614066 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.04■■■□□ 2.56
TULP1-208ENST00000614066 CUX1P39880 1505 aa31.01■■■□□ 2.55
TULP1-208ENST00000614066 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
TULP1-208ENST00000614066 TOP2BQ02880 1626 aa30.96■■■□□ 2.55
TULP1-208ENST00000614066 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.95■■■□□ 2.55
TULP1-208ENST00000614066 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.89■■■□□ 2.54
TULP1-208ENST00000614066 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.89■■■□□ 2.54
TULP1-208ENST00000614066 SOGA1O94964 1423 aa30.84■■■□□ 2.53
TULP1-208ENST00000614066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
TULP1-208ENST00000614066 TOPBP1Q92547 1522 aa30.77■■■□□ 2.52
TULP1-208ENST00000614066 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.76■■■□□ 2.51
TULP1-208ENST00000614066 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.75■■■□□ 2.51
TULP1-208ENST00000614066 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.75■■■□□ 2.51
TULP1-208ENST00000614066 ERCC6Q03468 1493 aa30.72■■■□□ 2.51
TULP1-208ENST00000614066 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.72■■■□□ 2.51
TULP1-208ENST00000614066 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.64■■■□□ 2.5
TULP1-208ENST00000614066 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.64■■■□□ 2.49
TULP1-208ENST00000614066 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TULP1-208ENST00000614066 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.57■■■□□ 2.48
TULP1-208ENST00000614066 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.57■■■□□ 2.48
TULP1-208ENST00000614066 EEA1Q15075 1411 aa30.55■■■□□ 2.48
TULP1-208ENST00000614066 CUX2O14529 1486 aa30.48■■■□□ 2.47
TULP1-208ENST00000614066 KIF27Q86VH2 1401 aa30.47■■■□□ 2.47
TULP1-208ENST00000614066 WDR62O43379 1518 aa30.46■■■□□ 2.47
TULP1-208ENST00000614066 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TULP1-208ENST00000614066 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.4■■■□□ 2.46
TULP1-208ENST00000614066 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TULP1-208ENST00000614066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TULP1-208ENST00000614066 IGF1RP08069 1367 aa30.29■■■□□ 2.44
TULP1-208ENST00000614066 WDR97A6NE52 1622 aa30.25■■■□□ 2.43
TULP1-208ENST00000614066 IFT140Q96RY7 1462 aa30.21■■■□□ 2.43
TULP1-208ENST00000614066 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TULP1-208ENST00000614066 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.19■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 PRXQ9BXM0 1461 aa30.18■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 GOLGA3Q08378 1498 aa30.17■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.17■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 KIF21BO75037 1637 aa30.16■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.14■■■□□ 2.42
TULP1-208ENST00000614066 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.11■■■□□ 2.41
TULP1-208ENST00000614066 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.04■■■□□ 2.4
TULP1-208ENST00000614066 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.02■■■□□ 2.4
TULP1-208ENST00000614066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
TULP1-208ENST00000614066 GRIN2BQ13224 1484 aa29.95■■■□□ 2.39
TULP1-208ENST00000614066 PBRM1Q86U86 1689 aa29.92■■■□□ 2.38
TULP1-208ENST00000614066 CUL7Q14999 1698 aa29.92■■■□□ 2.38
TULP1-208ENST00000614066 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
TULP1-208ENST00000614066 CEP162Q5TB80 1403 aa29.89■■■□□ 2.38
TULP1-208ENST00000614066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.82■■■□□ 2.36
TULP1-208ENST00000614066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.81■■■□□ 2.36
TULP1-208ENST00000614066 ADAMTS12P58397 1594 aa29.77■■■□□ 2.36
TULP1-208ENST00000614066 CLIP1P30622 1438 aa29.73■■■□□ 2.35
TULP1-208ENST00000614066 FBLN2P98095 1184 aa29.7■■■□□ 2.35
TULP1-208ENST00000614066 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
TULP1-208ENST00000614066 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TULP1-208ENST00000614066 SYNJ2O15056 1496 aa29.62■■■□□ 2.33
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