Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIT1Q9Y3P8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIT1Q9Y3P8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms