Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP18Q9UMW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP18Q9UMW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP18Q9UMW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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