Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ABT1Q9ULW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABT1Q9ULW3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ABT1Q9ULW3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ABT1Q9ULW3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABT1Q9ULW3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms