Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNOT8Q9UFF9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT8Q9UFF9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNOT8Q9UFF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT8Q9UFF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms