Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRP1BQ9NZR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRP1BQ9NZR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms