Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPL39Q9NYK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL39Q9NYK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL39Q9NYK5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms