Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MED17Q9NVC6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED17Q9NVC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED17Q9NVC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms