Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM140Q9NV12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM140Q9NV12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms