Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FARSBQ9NSD9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FARSBQ9NSD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSBQ9NSD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSBQ9NSD9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FARSBQ9NSD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARSBQ9NSD9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms