Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BATF3Q9NR55 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BATF3Q9NR55 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BATF3Q9NR55 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BATF3Q9NR55 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms