Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS2Q9NR19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS2Q9NR19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms