Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CASS4Q9NQ75 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASS4Q9NQ75 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms