Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC40A1Q9NP59 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC40A1Q9NP59 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC40A1Q9NP59 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms