Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC86Q9H6F5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC86Q9H6F5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC86Q9H6F5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms