Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX6-2Q9C056 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX6-2Q9C056 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKX6-2Q9C056 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms