Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM5Q9C035 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM5Q9C035 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM5Q9C035 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms