Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM3Q9BZL3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM3Q9BZL3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM3Q9BZL3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251 ms