Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAPERQ9BY12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SCAPERQ9BY12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SCAPERQ9BY12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SCAPERQ9BY12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms