Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM106CQ9BVX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM106CQ9BVX2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM106CQ9BVX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms