Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC11Q9BVV2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC11Q9BVV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms