Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOK2Q9BVS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK2Q9BVS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK2Q9BVS4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms