Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AGMATQ9BSE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AGMATQ9BSE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AGMATQ9BSE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGMATQ9BSE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms