Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERPUD2Q9BSE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERPUD2Q9BSE4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERPUD2Q9BSE4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERPUD2Q9BSE4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms