Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBF4Q9BQW3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EBF4Q9BQW3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF4Q9BQW3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms