Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNS3Q9BQ31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNS3Q9BQ31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms