Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOPXQ9BPY8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOPXQ9BPY8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOPXQ9BPY8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms