Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDX2Q99626 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDX2Q99626 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDX2Q99626 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDX2Q99626 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms