Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG1Q96Q15 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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