Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00052Q96N35 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00052Q96N35 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINC00052Q96N35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms