Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG8Q96MW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG8Q96MW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG8Q96MW5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG8Q96MW5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms