Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP6Q96FZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMP6Q96FZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP6Q96FZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms