Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC51Q96ER9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC51Q96ER9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC51Q96ER9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms