Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM18Q96B42 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM18Q96B42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM18Q96B42 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM18Q96B42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms