Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOCS4Q8WXH5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOCS4Q8WXH5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOCS4Q8WXH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOCS4Q8WXH5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOCS4Q8WXH5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SOCS4Q8WXH5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOCS4Q8WXH5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOCS4Q8WXH5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOCS4Q8WXH5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms