Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF12Q8WXF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF12Q8WXF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF12Q8WXF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms