Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMO3Q8TAP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMO3Q8TAP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMO3Q8TAP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMO3Q8TAP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms