Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLHC1Q8NHS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLHC1Q8NHS4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLHC1Q8NHS4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms