Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPC24Q8NBT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPC24Q8NBT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPC24Q8NBT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPC24Q8NBT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPC24Q8NBT2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms