Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC33Q8N5R6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC33Q8N5R6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC33Q8N5R6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms