Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBARPQ8N350 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBARPQ8N350 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBARPQ8N350 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBARPQ8N350 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CBARPQ8N350 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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