Protein–RNA interactions for Protein: Q8N268

C20orf197, Uncharacterized protein C20orf197, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf197Q8N268 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C20orf197Q8N268 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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