Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNTD2Q8IXW0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNTD2Q8IXW0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms