Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC50Q8IVM0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC50Q8IVM0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC50Q8IVM0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC50Q8IVM0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms