Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00523Q86TU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00523Q86TU6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00523Q86TU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00523Q86TU6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.5 ms