Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
BRINP3Q76B58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
BRINP3Q76B58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BRINP3Q76B58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRINP3Q76B58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
BRINP3Q76B58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms