Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR88Q6ZMY6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR88Q6ZMY6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR88Q6ZMY6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.4 ms