Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLC3Q6P597 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLC3Q6P597 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLC3Q6P597 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms