Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD16Q68DU8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD16Q68DU8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD16Q68DU8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD16Q68DU8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms